Приблизно через 20 років після публікації першого генома людини геноміка перетворюється з дослідницької практики на рушій персоналізованої медицини. Залучаючись до цього переходу, глобальна біофармацевтична компанія AstraZeneca прискорює використання геноміки в прецизійній медицині та продовжує трансляцію геноміки для трансформації відкриття ліків.
AstraZeneca використовує петабайти даних геномного секвенування для дослідження та розробки ліків. Щоб швидко обробляти дані в масштабі, AstraZeneca використовувала Amazon Web Services (AWS), щоб створити швидке й ефективне рішення для отримання вражаючої інформації про геноміку.
У 2020 році ми внесли генетичний внесок у більш ніж 40 проектів AstraZeneca з розробки ліків, використовуючи ці можливості».
Славе Петровскі, віце-президент, керівник відділу геномної аналітики та інформатики, Центр досліджень геноміки, R&D, AstraZeneca
Створення рішення, яке дає вченим можливість впроваджувати інновації
На додаток до швидкого отримання інформації з геномних даних, AstraZeneca хотіла перерозподілити ресурси на наукові дослідження та уникнути витрачання часу біоінформатики на виконання відносно малоцінних дій з управління даними. Оскільки компанія збирає петабайти даних із кількох джерел великими пакетами, їй потрібна потужна обчислювальна потужність із можливістю масштабування.
Спираючись на AWS раніше, AstraZeneca вирішила розширити використання інструментів AWS для розробки хмарного біоінформаційного рішення для швидкої геномної обробки та аналітики.
Автоматизація в AWS для швидкого отримання інформації
Високопродуктивне рішення AstraZeneca виконує багато етапів обробки та аналізу геномних даних. Геномний вторинний аналіз розглядає необроблені зчитування послідовності, щоб реконструювати геном і ідентифікувати геномні варіанти, які можна проаналізувати далі на наступних стадіях. Для автоматизації оркестровки даних цих кроків архітектура використовує AWS Lambda , безсерверний обчислювальний сервіс, який дозволяє користувачам запускати код без підготовки або керування серверами. Щоб побудувати рівень виконання завдань, архітектура використовує AWS Batch , який динамічно забезпечує оптимальну кількість і тип обчислювальних ресурсів, таких як ЦП або оптимізовані для пам’яті екземпляри, на основі обсягу та конкретних вимог до ресурсів надісланих пакетних завдань. Попутно архітектура сортує дані у відра за допомогою Amazon Simple Storage Service (Amazon S3), служба зберігання об’єктів.
На AWS AstraZeneca пришвидшила та покращила продуктивність за допомогою масштабу, обчислювальної потужності та доступу до різноманітних технологічних сервісів. Оскільки компанія може за потреби проводити масштабний аналіз, дані стають доступними для аналізу швидше. «Тепер ми можемо провести понад 51 мільярд статистичних тестів менш ніж за 24 години, вивчаючи наслідки окремих мутацій або окремих генів, кожен із яких має широкий спектр фенотипів», — каже Славе Петровскі, віце-президент, керівник відділу геномної аналітики та інформатики Центру AstraZeneca для Дослідження геноміки. Зусилля компанії окупаються. «У 2020 році ми внесли генетичний внесок у більш ніж 40 проектів AstraZeneca з розробки ліків, використовуючи ці можливості», — каже Петровскі.
Стимулювання наукових інновацій
AstraZeneca розробила швидкий і ефективний конвеєр геномної біоінформатики, який дає вченим час і ресурси для впровадження інновацій. У результаті Центр геномних досліджень компанії просувається вперед у своїй меті проаналізувати два мільйони геномів до 2026 року.
Про AstraZeneca
AstraZeneca — глобальна біофармацевтична компанія, що розробляє інноваційні ліки в ряді терапевтичних напрямків. Центр геномних досліджень є ініціативою AstraZeneca, метою якої є аналіз двох мільйонів геномів до 2026 року.
Переваги AWS
- Підтримує виконання понад 51 мільярда статистичних тестів менш ніж за 24 години
- Спрощена доставка геномної інформації для більш ніж 40 проектів з розробки ліків у 2020 році
- Масштаби вгору або вниз, щоб відповідати нестабільним вимогам до геномного секвенування
- Звільняє ресурси для наукових досліджень
Використані послуги AWS
AWS Лямбда
AWS Lambda — це безсерверний обчислювальний сервіс, який дає змогу запускати код без підготовки та керування серверами, створюючи логіку масштабування кластера з урахуванням робочого навантаження, підтримуючи інтеграцію подій або керуючи часом виконання. Дізнатись більше
Пакет AWS
AWS Batch дозволяє розробникам, науковцям та інженерам легко та ефективно виконувати сотні тисяч пакетних обчислень на AWS. Дізнатись більше
Amazon S3
Amazon Simple Storage Service (Amazon S3) — це служба зберігання об’єктів, яка пропонує найкращі в галузі масштабованість, доступність даних, безпеку та продуктивність. Дізнатись більше
Компанії будь-якого розміру в усіх галузях щодня трансформують свій бізнес за допомогою AWS. Зв’яжіться з нашими експертами та почніть власну подорож до AWS Cloud вже сьогодні.
Зателефонуйте нам за номером +38 (044) 277-23-23 або надішліть нам листа за адресою aws@wiseit.com.ua, і ми детальніше розповімо вам про хмарні рішення AWS, так їх переваги.